脑卒中研究所以首都医科大学附属北京天坛医院为主要依托单位
阿尔茨海默病研究所由7个研究室组成,分别是阿尔茨海默氏病流行病学研究室。
帕金森病研究所建立了中国帕金森氏病临床多中心和社区研究队列和样本库,
脑肿瘤研究所下设8个研究室,分别是生物样本库,神经电生理研究室,神经病理学研究室
癫痫研究所由10个研究室组成,分别是癫痫流行病学研究室,癫痫遗传病研究室
神经损伤与康复研究所由5个研究平台组成,分别是基础研究平台,临床研究平台
抑郁症研究所由六个研究室组成,分别是应用基础研究室,抑郁症资源库研究室,
精神分裂症研究所由8个研究室组成,分别是神经心理学研究室,神经生理学研究室